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一、培訓(xùn)班上課內(nèi)容 
      上課內(nèi)容涵蓋“基因組學(xué)―蛋白質(zhì)組學(xué)―系統(tǒng)生物學(xué)”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進展及其在各生物學(xué)科中的應(yīng)用。 
核心課程包括： 
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術(shù)原理與進展（講課人：于 軍 教授） 
2. 轉(zhuǎn)錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應(yīng)用、微生物基因組學(xué)、基因組學(xué)與醫(yī)學(xué)（講課人：胡松年教授） 
3. 系統(tǒng)生物學(xué)建模分析及高通量分析技術(shù)應(yīng)用（講課人：楊軍、陳銘教授等） 
4. 蛋白質(zhì)組學(xué)概論及應(yīng)用 （講課人：鐘伯雄教授）

二、培訓(xùn)班上機內(nèi)容 
      上機實習(xí)課采用 “跟我學(xué)”方式，學(xué)習(xí)實踐各類基礎(chǔ)生物信息學(xué)軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學(xué)會基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基本方法。

主要內(nèi)容如下： 
實習(xí)一： 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析
      通過序列比對工具BLAST的學(xué)習(xí)，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復(fù)制在進化上的功能；學(xué)習(xí)基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。 
實習(xí)二： 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
      介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義。 
實習(xí)三：系統(tǒng)生物學(xué)軟件實習(xí)-----網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析 
      利用Cytoscape系統(tǒng)生物學(xué)分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。 
實習(xí)四：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析 
      從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始，接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進行分析，預(yù)測目標(biāo)蛋白的生物功能。 
實習(xí)五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析 
      使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學(xué)分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習(xí)。

三、培訓(xùn)對象 

無生物信息學(xué)背景，希望了解生物信息學(xué)的學(xué)員； 
計劃開展各類組學(xué)研究的科研人員； 
已有組學(xué)數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員； 
有志從事生物信息學(xué)相關(guān)工作的學(xué)生或者技術(shù)人員。